蛋白互作网络，即Protein-Protein Interaction（PPI）Network，是描述一组蛋白质间相互作用关系的分析方式。蛋白间的相互作用关系错综复杂，每个蛋白都是一个节点，多个蛋白间的相互作用连成线条构成网状结构。蛋白质作为生命活动的主要承担者，参与了生物信号传递、基因表达调控、代谢和细胞周期调控等过程。因此，系统分析PPI网络有助于揭示蛋白质功能机制及疾病等特殊状态下的生物反应机制。
注： 差异表达蛋白互作网络图。图中圆圈代表差异蛋白，不同颜色代表蛋白的差异表达情况，红色为上调蛋白，蓝色为下调蛋白，节点大小代表蛋白之间相互作用的个数，节点越大代表与该节点相互作用的蛋白个数越多。
