TMT（Tandem Mass Tags）和iTRAQ（Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation）技术是分别由美国AB SCIEX公司和Thermo公司研发的多肽体外标记定量技术，是目前运用最广泛的两种标记定量蛋白质组技术。两者原理相似，均利用多种同位素标签与氨基（包括氨基酸N端及赖氨酸侧链氨基）反应，结合高精度质谱分析技术，能够同时实现多个生物样品的蛋白质定性和定量。主要区别在于：TMT技术最高可同时标记16个不同的生物样品，而iTRAQ技术最多可标记8个不同的生物样品。
TMT/iTRAQ标记试剂由反应基团+平衡基团+报告基团三部分组成，在每个试剂盒中，平衡基团+报告基团的质量总和保持一致，但报告基团的大小不同。TMT/iTRAQ试剂通过标记酶解后的肽段的N端或赖氨酸侧链氨基。在质谱分析中，同量异序标签都能够产生一个独特的离子图谱，因此可以利用该标签进行定量。在一级质谱分析中，标记的多肽是无法区分出来的。肽段在进入二级质谱时，报告基团、平衡基团和反应基团之间的键断裂，带不同同位素标签的同一肽段产生质量不同的报告离子峰。通过比较二级谱图中的不同报告离子峰的强度就可以对蛋白进行定量分析。
1、适用范围广：可检测胞浆、线粒体、膜和核蛋白，适用于各种类型蛋白质
2、高通量：一次可以实现多个样品的定性定量分析
3、结果可靠：高灵敏度串联质谱同步定性定量，重复性高
4、灵敏度高：分级分离，降低样品复杂度，可检测低丰度蛋白
5、分离能力强：有效分离酸/碱性、小于10KDa或大于200KDa分子量及难溶性蛋白
